Derde overgangsperiode (OK. 1085-656 p.n.e.).
Onder de heerschappij van de 21ste dynastie splitste Egypte zich feitelijk in twee organismen. Er waren dus twee machtscentra – in het noorden, in Tanis, waar de nakomelingen van Smendes regeerden, en in het zuiden, waar de hogepriesters van Amon in Thebe regeerden – opvolgers van Herhor. Beide lijnen beschouwden zichzelf als rechtmatige heersers, en ze worden gezamenlijk de 21ste dynastie genoemd. In de coma van de periode verschenen er nieuwe, machtige heersers. Afkomstig uit Bubastis in Delta stichtten Sheshonq I en zijn nakomelingen de XXII-dynastie, genaamd Libisch. Tussen hen en de vorsten van Thebe, beschouwt zichzelf als de XXIII-dynastie, er was een burgeroorlog, waar de zuiderburen van Egypte gebruik van maakten, De Kushites (Nubiërs), kort de Egyptische troon veroveren en de XXTV-Kuszyce-dynastie stichten. De interne situatie werd ingewikkeld, omdat er soms meerdere machtscentra waren.
De goddelijke vrouwen van Amon regeerden in Thebe, priesteressen met bijna faraonische krachten, die meestal zusters of dochters waren van de heersers van de Libische dynastie, en Kuszycka, en hun opvolgers werden gekozen door adoptie. Dit is een van de minst bekende periodes in de geschiedenis van Egypte, vandaar enkele controversiële onderzoekers, als David Rohl, ze denken, dat het moet worden ingekort en dus de chronologie verandert. De zwakte van de regering in Egypte lokte zijn buurlanden uit om binnen te vallen: Nubische King Pie (Pianchy) veroverde Memphis, en zijn broer Shabaka nam Delta over en riep zichzelf uit tot heerser over heel Egypte. 25 dynastie – Nubisch - consolideerde de afbrokkelende staat, en Amon werd weer een staatsgod. Uit deze periode zijn talloze gebouwen bewaard gebleven, zoals de Taharki-kiosk in Karnak. Ondertussen werd Egypte vanuit het noordoosten bedreigd door de Assyriërs, die het land zijn binnengevallen, ze namen het noorden van Memphis over en plunderden Thebe. De Nubische heerser verliet Egypte en vluchtte naar Nubië. Zo eindigde de derde interimperiode.
Late periode (OK. 565-332 p.n.e.).
In het noorden van Egypte was de Assyrische invloed al in een eerder tijdvak gemarkeerd. Sommige van de Delta-vorsten erkenden de hegemonie ervan, dat duurde tot op het moment, toen de Assyriërs, zichzelf bedreigd door de Babylonische invasie, ze moesten zich terugtrekken.
Hun plaatsvervanger van Sais, Necho ik, hij stichtte de XXVI-dynastie – saicka, wiens heersers opzettelijk een beroep deden op de macht van het Oude Koninkrijk.
Dit is de laatste grote periode van beschaving aan de Nijl, toen zee-expedities en navigatie langs het kanaal dat de Nijl met de Rode Zee verbindt, de richting van toekomstige tijden bepalen. De farao's gingen naar het Midden-Oosten, laten zien, dat het hun invloedsgebied is, die echter de sluimerende leeuw wakker maakte – Babyloniërs. En hoewel Psametik II erin slaagde de staat te versterken, het einde naderde snel, en het echte gevaar kwam uit Perzië. Amazi's, een van de commandanten van Psametik, greep de macht van de zwakke Apries en probeerde het land te beschermen tegen de Perzen, maar hij sloot de verkeerde allianties. Perzische invasie van 526 r. p.n.e. eindigde met de verovering van Egypte, maar Amazis heeft het nu meegemaakt. Zo begon het bewind van buitenlandse heersers. De Perzische koningen introduceerden een sterk bewind. Ze werden officieel beschouwd als Egyptische farao's (27 dynastie), want zij bouwden en herstelden de tempels, dus lokte hun heerschappij tegenstand en bloedige onderdrukking uit. Tijdens het bewind van Artaxerxes II verzwakte de bezettingsmacht in Egypte als gevolg van interne strijd in Perzië, waar Amyrtajos van Sais van profiteerde, wie won zijn vrijheid op 60 lats. Er is weinig bekend over deze enige vertegenwoordiger van de XXVIII-dynastie, zelfs zijn troonnaam is onbekend. Zijn zoon kon hem niet opvolgen vanwege de fouten van zijn vader die vandaag onbekend zijn en moest zich overgeven aan de heersers van Mendes in de Delta. (XXIX dynastie), heersend 20 jaren, die te maken hadden met de invasies van Perzische troepen. Het is moeilijk te bewijzen, weet je zeker dat Nektanebo I, zoon van een soldaat van Sebennytos, won de troon door politieke moord. Hij stichtte de XXX-dynastie, heersend in Egypte tot 341 r. p.n.e., toen het land bezweek aan de Perzische invasie. Tegen Artaxerxes III werd Nectanebo II verslagen en trok zich terug in Nubië, stoel, dat hij alsnog terug zou komen. Hij stierf in het buitenland. Perzen regeerden het land tot de tijd van Alexander de Grote.
Ptolemeïsche periode (330-30 p.n.e.).
Alexander veroverde trouwens Egypte. Hij werd behandeld als een redder uit Perzische gevangenschap, en de kroning van Farao was een buiging voor zijn nieuwe onderdanen. Het bezoek aan het orakel van Amon in Siwa markeerde de richting van verdere veroveringen. En hoewel hij nooit is teruggekeerd naar Egypte, hij liet een aandenken achter – nieuwe stad, Alexandrië. De nieuwe heersers van de Ptolemeïsche dynastie verhuisden naar haar, regeren het land tot 30 r. p.n.e., toen Cleopatra VII zelfmoord pleegde. Macedonische heersers, beter of slechter geïntegreerd met Egypte, ze creëerden een staat aan de Nijl, waar naast Helleense invloeden ook Egyptische tradities bestonden. Alexandrië met zijn bibliotheek, wetenschap, kunst en literatuur zijn de culturele hoofdstad van de Middellandse Zee geworden. En hoewel in het midden van de tweede eeuw. p.n.e. Egyptische koningen stopten met beslissen over de richting van het buitenlands beleid, de Ptolemeïsche staat was beroemd om zijn rijkdom. Dromen van macht, waar Cleopatra van droomde, had geen kans op implementatie, omdat iemand anders de kaarten al had gedeeld – Rome. En zelfs de hulp van Julius Caesar of Marcus Antonius kon de loop van de geschiedenis niet terugdraaien.